鼓勵畜禽糞便這一有機肥料的綜合利用，走農牧結合、種養結合的模式，最經濟的做法是直接還田，在環保和畜牧業都走在世界先進行列的荷蘭，牛糞經簡單的干濕分離后直接還田，歐美一些發達國家還規定了每公頃土地對應的有機肥使用量。畜禽糞便除了直接還田，有條件的還可以經發酵、烘干、建沼氣發電等多種合理利用形式。

福航環保自主研發山東福航新能源環保股份有限公司自主研發的智能高溫好氧污泥處理設備主要是對畜禽糞便、廚余垃圾、生活污泥等廢棄物進行高溫好氧發酵，利用微生物的活性對廢棄物中的有機質進行生物分解，使其達到無害化、穩定化、減量化、資源化利用的一體化污泥處理設備。從我國農業生產的發展和市場需求看，未來有機肥的發展潛力十分廣闊。隨著我國農業產業結構調整和“三綠工程”的實施，優質、高效生態農業種植面積將逐年擴大，綠色食品、有機食品生產基地的擴大必然形成對有機肥的巨大需求。與此同時，國家對改善生態環境的巨大投入必將有效拉動林、草、花卉用肥需求的迅猛增長。

總體上，由于長期忽視對固體廢物的管理以及技術裝備等的不足，我國的堆肥產業仍處在一個發展初期，堆肥規模、堆肥廠的數量以及堆肥工藝水平基本停留在一個粗放式的簡單加工階段，與發達國家相比距離甚遠，未來各類有機固體廢棄物的處理任務將十分龐大，也預示著這一產業有著廣闊的發展空間。

智能高溫好氧發酵設備工作原理：將廢棄物(畜禽糞便、廚余垃圾、生活污泥等)、生物質(秸稈及鋸末等)以及回流物料按照一定比例混合均勻，使含水率達到設計要求60-65%后進入立體好氧系統，通過調節原料的水分、氧氣含量和溫度變化，使物料進行充分的好氧發酵分解，分解過程中釋放的熱量能夠使污泥自身溫度增高，溫度最高能夠達到80℃，污泥中的水分隨著溫度的上升被蒸發，部分有機物被分解，從而使污泥堆體體積減小，到達污泥的減量化處理。智能高溫好氧污泥處理設備通過通風、充氧、攪拌等作用控制溫度在55~60℃之間，達到污泥發酵處理的溫度，在此溫度時，能夠使污泥堆體中的大量病原菌和寄生蟲死亡，同時利用除臭系統對排放的氣體進行生物臭味，達到污泥無害化處理的目的。污泥高溫好氧發酵后得產品，可用于土壤改良、園林綠化、垃圾填埋覆蓋土等。

事實上，畜禽糞污處理發酵罐，要求不產生二次污染，處理過程中糞污不落地，有機廢棄物含有大量且豐富的營養成份可供農業與飼料業使用。將動物糞便與廚余用堆肥處理可減低微生物活動及濕度，堆肥中有機質可改善土壤吸收營養與含水的能力，降低肥料使用及避免耕種時土壤流失，減少臭味與蒼繩問題。雖然堆肥處理有許多好處，它并不保證解決所有的動物糞便與廢棄物管理的問題。堆肥處理需要大量時間與金錢運作管理，它也需要額外的土地及三周至兩個月成熟時間，野堆式堆肥及儲料設施占用大量土地與建筑物空間。較大型堆肥處理操作，則為資本密集及勞力密集工作，其中最嚴重問題是隨之而來的污染四逸及惱人的惡臭。若野堆式堆肥含有過量的氮，亞硝酸鹽的臭味就成為惱人問題，超載的養分污染四逸及污染滲透則是其他另外潛在污染問題。